Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp5eP56382 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp5eP56382 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms