Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rab4aP56371 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab4aP56371 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab4aP56371 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab4aP56371 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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