Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cav1P49817 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms