Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl5P47962 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms