Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms