Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx2-5P42582 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms