Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp4P35123 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp4P35123 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms