Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola2P33611 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola2P33611 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pola2P33611 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola2P33611 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola2P33611 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola2P33611 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola2P33611 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola2P33611 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pola2P33611 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola2P33611 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pola2P33611 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pola2P33611 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola2P33611 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola2P33611 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola2P33611 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pola2P33611 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola2P33611 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola2P33611 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms