Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnd3P30282 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd3P30282 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnd3P30282 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms