Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TbpP29037 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TbpP29037 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TbpP29037 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TbpP29037 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TbpP29037 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TbpP29037 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TbpP29037 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TbpP29037 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TbpP29037 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TbpP29037 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TbpP29037 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TbpP29037 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TbpP29037 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TbpP29037 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TbpP29037 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TbpP29037 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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