Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdnP25233 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdnP25233 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdnP25233 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdnP25233 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdnP25233 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NdnP25233 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NdnP25233 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms