Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RarbP22605 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RarbP22605 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RarbP22605 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RarbP22605 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RarbP22605 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RarbP22605 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RarbP22605 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RarbP22605 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RarbP22605 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RarbP22605 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RarbP22605 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RarbP22605 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RarbP22605 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RarbP22605 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RarbP22605 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RarbP22605 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RarbP22605 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RarbP22605 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RarbP22605 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms