Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csn1s1P19228 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms