Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CnpP16330 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CnpP16330 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CnpP16330 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CnpP16330 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CnpP16330 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CnpP16330 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CnpP16330 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CnpP16330 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CnpP16330 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CnpP16330 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CnpP16330 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CnpP16330 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CnpP16330 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CnpP16330 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CnpP16330 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CnpP16330 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CnpP16330 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CnpP16330 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CnpP16330 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CnpP16330 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CnpP16330 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CnpP16330 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CnpP16330 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CnpP16330 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CnpP16330 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CnpP16330 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CnpP16330 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CnpP16330 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CnpP16330 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CnpP16330 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CnpP16330 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms