Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme1P15532 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme1P15532 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme1P15532 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme1P15532 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms