Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sub1P11031 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sub1P11031 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms