Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jmjd7P0C872 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms