Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igsf6P0C6B7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms