Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms