Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gap43P06837 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gap43P06837 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gap43P06837 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms