Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04214 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04214 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04214 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04214 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04214 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04214 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P04214 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04214 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04214 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04214 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04214 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04214 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P04214 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P04214 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P04214 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P04214 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P04214 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P04214 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P04214 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P04214 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P04214 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P04214 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P04214 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P04214 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
P04214 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P04214 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P04214 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
P04214 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P04214 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P04214 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms