Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01789 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01789 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01789 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01789 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01789 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01789 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01789 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01789 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01789 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms