Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01659 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01659 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01659 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01659 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01659 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01659 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01659 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01659 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01659 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01659 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01659 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01659 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms