Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01658 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01658 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01658 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01658 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01658 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01658 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01658 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01658 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01658 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01658 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01658 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01658 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01658 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01658 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01658 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01658 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01658 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01658 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms