Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4bP01029 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4bP01029 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4bP01029 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C4bP01029 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4bP01029 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4bP01029 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4bP01029 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4bP01029 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4bP01029 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4bP01029 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4bP01029 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4bP01029 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4bP01029 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4bP01029 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4bP01029 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4bP01029 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4bP01029 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4bP01029 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4bP01029 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4bP01029 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4bP01029 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C4bP01029 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4bP01029 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4bP01029 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4bP01029 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4bP01029 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4bP01029 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4bP01029 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4bP01029 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4bP01029 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4bP01029 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4bP01029 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4bP01029 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4bP01029 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C4bP01029 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4bP01029 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4bP01029 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms