Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ComtO88587 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ComtO88587 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ComtO88587 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ComtO88587 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ComtO88587 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ComtO88587 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ComtO88587 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ComtO88587 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ComtO88587 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ComtO88587 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ComtO88587 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ComtO88587 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ComtO88587 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ComtO88587 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ComtO88587 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ComtO88587 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ComtO88587 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ComtO88587 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ComtO88587 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ComtO88587 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ComtO88587 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ComtO88587 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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ComtO88587 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ComtO88587 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ComtO88587 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ComtO88587 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ComtO88587 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ComtO88587 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ComtO88587 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ComtO88587 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ComtO88587 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ComtO88587 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ComtO88587 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ComtO88587 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ComtO88587 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms