Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfi1bO70237 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms