Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp9aO70228 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms