Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LatO54957 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LatO54957 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LatO54957 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LatO54957 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LatO54957 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LatO54957 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LatO54957 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LatO54957 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LatO54957 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LatO54957 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LatO54957 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LatO54957 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LatO54957 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LatO54957 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LatO54957 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LatO54957 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LatO54957 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LatO54957 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LatO54957 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LatO54957 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LatO54957 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LatO54957 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms