Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole2O54956 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole2O54956 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms