Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NlkO54949 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NlkO54949 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NlkO54949 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NlkO54949 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NlkO54949 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NlkO54949 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NlkO54949 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NlkO54949 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NlkO54949 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NlkO54949 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NlkO54949 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms