Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Bnc1O35914 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Bnc1O35914 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnc1O35914 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bnc1O35914 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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