Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf12O35738 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf12O35738 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms