Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ube3aO08759 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3aO08759 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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