Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CltaO08585 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CltaO08585 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CltaO08585 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CltaO08585 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CltaO08585 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CltaO08585 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CltaO08585 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CltaO08585 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CltaO08585 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CltaO08585 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CltaO08585 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CltaO08585 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CltaO08585 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CltaO08585 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CltaO08585 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CltaO08585 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CltaO08585 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CltaO08585 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CltaO08585 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CltaO08585 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CltaO08585 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CltaO08585 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CltaO08585 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CltaO08585 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CltaO08585 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CltaO08585 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CltaO08585 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CltaO08585 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltaO08585 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltaO08585 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltaO08585 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CltaO08585 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltaO08585 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltaO08585 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltaO08585 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CltaO08585 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltaO08585 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltaO08585 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CltaO08585 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltaO08585 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltaO08585 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltaO08585 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms