Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp2O08574 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms