Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms