Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms