Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933403O08RikF6UK53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms