Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sptbn5F6UCX4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn5F6UCX4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms