Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms