Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610021A01RikE9Q0Q3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms