Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0J0

Defa34, Defensin, alpha, 34, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa34D3Z0J0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa34D3Z0J0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa34D3Z0J0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms