Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc8D3YZV8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms