Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce3B5KM66 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms