Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah3B2RWG3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms