Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms