Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prrt4B2RU40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prrt4B2RU40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt4B2RU40 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms