Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed5B2RPU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed5B2RPU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed5B2RPU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed5B2RPU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed5B2RPU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed5B2RPU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed5B2RPU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms