Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms